能源微生物功能基因组的整合分析数据库是针对微藻等能源生物，允许协同分析与注释，整合基因组、转录物组、蛋白组、代谢物组、相互作用组学（Interactome）等功能基因组学数据的信息系统。其主要功能是支撑国际范围内的微藻分子生物学科研群体对微藻表观型和基因型的相互关系进行交叉考证，供远程和本地科研用户存储、分析、整合与可视化已发表的和未发表的能源微生物基因组和功能基因组数据。其设计目标是成为在国际微藻乃至所有微生物科研群体中有公信力和广泛用户的一个重要科研平台，为工业化利用能源微藻等能源微生物作为生物质能资源的研究和开发提供一个核心的工具。

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支撑基于质谱（及核磁共振）的高通量蛋白质组及代谢物组分析。提供胞内代谢物、生化反应、酶、代谢途径等层次的整合代谢数据，提供从基因组代谢重建、整合核磁共振和质谱的高通量代谢物定性定量分析、代谢途径校验及分析等集成工具及服务。

支撑基于DNA测序技术的高通量基因组及转录物组分析。提供测序项目全生命周期的中间数据追踪和保存，工作流控制和质量监控服务；提供整合的序列拼装、基因结构预测、基因协同注释等分析工具及环境，允许多用户同时分析与注释基因组数据。